C’est le grand séquoia des arbres généalogiques.
Des chercheurs du Big Data Institute de l’Université d’Oxford ont créé le plus grand arbre généalogique jamais créé, qui relie plus de 27 millions de personnes – vivantes et décédées depuis longtemps – à travers le monde.
Cela marque une étape majeure dans le cheminement vers la cartographie de l’intégralité des relations génétiques humaines, selon l’étude révolutionnaire publiée dans Science.
L’arbre généalogique nous aide à en savoir plus sur où et quand nos ancêtres humains ont vécu – à savoir en Afrique – ont déclaré les chercheurs.
Il pourrait également prédire qui pourrait être plus sensible aux maladies telles que COVID-19.
“Nous avons fondamentalement construit un immense arbre généalogique, une généalogie pour toute l’humanité, qui modélise aussi exactement que possible l’histoire qui a généré toutes les variations génétiques que nous trouvons chez les humains aujourd’hui”, co-auteur Yan Wong, généticien évolutionniste au institut, a déclaré dans un communiqué. “Cette généalogie nous permet de voir comment la séquence génétique de chaque personne est liée à l’autre, le long de tous les points du génome.”
En termes simples, l’arbre complet, qui est apparu à la fois comme un document de recherche et une vidéo, décrit comment les gens du monde entier sont interdépendants, comme un 23andMe englobant tout.
Jusqu’à présent, les cartographes génétiques avaient du mal à concevoir des algorithmes pour traiter ces énormes quantités de données. Cependant, grâce à la nouvelle méthode détaillée dans l’étude, les chercheurs peuvent facilement faire correspondre des données provenant de plusieurs sources et incorporer des millions de séquences génétiques.
“Essentiellement, nous reconstruisons les génomes de nos ancêtres et les utilisons pour former un vaste réseau de relations”, a expliqué l’auteur principal Anthony Wilder Wohns, qui a entrepris la recherche dans le cadre de son doctorat. au BDI. “Nous pouvons alors estimer quand et où ces ancêtres ont vécu.”
Il a ajouté: “La puissance de notre approche est qu’elle fait très peu d’hypothèses sur les données sous-jacentes et peut également inclure des échantillons d’ADN modernes et anciens.”
Plus précisément, l’étude mélange et apparie les données des génomes humains modernes et anciens de huit bases de données différentes, couvrant un total de 3 609 séquences génomiques individuelles de 215 populations à travers le monde. L’âge des génomes anciens variait de 1 000 à plus de 100 000, tandis que “le réseau résultant contenait près de 27 millions d’ancêtres”.
Pour l’étude, les algorithmes “ont prédit où les ancêtres communs doivent être présents dans les arbres évolutifs pour expliquer les schémas de variation génétique”.
La carte utilisait également des données de localisation, permettant aux scientifiques d’estimer où les ancêtres communs avaient vécu, et incluait des événements évolutifs séminaux tels que notre migration hors d’Afrique, selon l’étude. Les premiers ancêtres inclus dans la carte sont une espèce humaine éteinte qui est antérieure à Homo sapiens. Ils vivaient il y a un million d’années dans une région considérée comme le Soudan moderne.
Bien qu’indéniablement impressionnant, l’arbre généalogique sans précédent n’est que le fondement “de la prochaine génération de séquençage d’ADN”, a déclaré Wong. Les scientifiques du génome travaillent actuellement à rendre le plan encore plus complet en “continuant d’incorporer les données génétiques au fur et à mesure qu’elles deviennent disponibles”.
Leur but ultime : Produire une carte globale de la façon dont tout le monde est lié les uns aux autres.
“Au fur et à mesure que la qualité des séquences génomiques des échantillons d’ADN modernes et anciens s’améliorera, les arbres deviendront encore plus précis, et nous pourrons éventuellement générer une carte unique et unifiée qui explique la descendance de toutes les variations génétiques humaines que nous voyons aujourd’hui, », a déclaré Wang.
La carte n’est pas seulement applicable aux humains.
“Alors que les humains sont au centre de cette étude, la méthode est valable pour la plupart des êtres vivants, des orangs-outans aux bactéries”, a expliqué Wohns. En d’autres termes, cela pourrait littéralement décrire quel singe était votre oncle.
Dans une étude similaire et plus urgente de 2020, des scientifiques du Département de la santé et de l’hygiène mentale de la ville de New York ont analysé le matériel génétique du coronavirus pour essayer de prédire les origines des futures épidémies.
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