Les étiquettes d’ADN dans le placenta indiquent un gène possible lié à l’autisme | : Spectre:

Peptide placentaire : Le gène nouvellement découvert, NHIP, code un peptide dans les neurones et semble être sous-actif dans les placentas à la naissance d’enfants autistes.

Selon une nouvelle analyse de l’ADN dans le placenta, un gène qui n’était pas lié à l’autisme auparavant modifie l’expression d’autres gènes associés à la maladie.

Le génome d’un placenta provient du fœtus et présente un schéma unique de méthylation, la suite d’étiquettes chimiques appelées groupes méthyle qui se fixent à l’ADN pour réguler l’expression des gènes. Le schéma peut refléter le développement du cerveau et les chances d’un enfant d’être autiste, selon certaines recherches.

Dans le nouveau travail, les chercheurs ont analysé les niveaux de méthylation sur l’ensemble du génome dans 204 placentas issus de la naissance d’enfants qui ont un frère aîné autiste ; ces enfants, connus sous le nom de “baby sibs”, ont un risque accru d’être autistes. Un tronçon d’ADN appelé 22q13.33, qui n’a pas été lié à l’autisme auparavant, a tendance à être moins méthylé dans les placentas à la naissance d’enfants qui sont diagnostiqués plus tard avec la maladie, ont découvert les chercheurs.

Les résultats, ainsi que des travaux antérieurs sur le méthylome placentaire, montrent que l’organe peut ” refléter ” les schémas de méthylation et les niveaux d’expression génique dans le cerveau fœtal, déclare la chercheuse principale Janine LaSalle, professeure de microbiologie médicale et d’immunologie à l’Université de Californie, Davis. . .

“Nous ne savons pas exactement pourquoi”, dit La Salle. “Mais c’est excitant dans la mesure où le placenta pourrait être un bon substitut pour ce qui s’est passé dans le cerveau pendant le développement.”

L’étude démontre l’importance d’étudier le placenta souvent ignoré pour comprendre le développement du cerveau, explique Anna Penn, professeure agrégée de pédiatrie à l’Université de Columbia, qui n’a pas participé aux travaux.

“Si nous voulons comprendre les maladies que nous avons identifiées comme ayant potentiellement une origine dans le développement fœtal, nous pouvons continuer à ignorer le rôle du placenta”, déclare Penn, qui a inventé le terme “neuroplacentologie” pour décrire l’étude de les effets du placenta sur le développement du cerveau fœtal. “Peut-être qu’un jour nous respecterons suffisamment le placenta pour ne pas le jeter.”

L :L’équipe d’aSalle a identifié 134 régions génomiques couvrant 183 gènes – dont beaucoup sont liés à l’autisme – qui montrent différents modèles de méthylation chez les enfants autistes par rapport aux enfants non autistes. Douze des régions, toutes avec des niveaux de méthylation inhabituellement bas, sont situées en 22q13.33. Bien que ce tronçon du chromosome 22 n’ait pas été précédemment associé à l’autisme, il est voisin de 22q13.3, qui abrite SHANK3 et plusieurs autres gènes liés à l’autisme, à la déficience intellectuelle ou aux troubles neuropsychiatriques.

“En savoir plus sur ce qui peut se passer dans cette région sera potentiellement une étape supplémentaire pour le domaine de l’autisme”, déclare la chercheuse de l’étude Yihui Zhu, scientifique en bioinformatique appliquée à 10x Genomics à Pleasanton, en Californie, qui a terminé l’étude dans le cadre de son doctorat. recherche dans le laboratoire de LaSalle.

La région ne contient aucun gène précédemment identifié, mais une séquence code pour un peptide exprimé dans le cerveau, le placenta et les ovaires, a découvert l’équipe. L’expression du gène augmente après la maturité des neurones et en réponse au stress oxydatif, des cellules dérivées du tissu cérébral embryonnaire ont été révélées. Les chercheurs ont nommé le gène neuronal hypoxie inductible, associé au placenta ou NHIP.

Les placentas d’enfants autistes ont des niveaux de NHIP inférieurs à ceux d’enfants non autistes.

Les résultats ont été publiés dans : Biologie du génome : en février.

Une variante structurelle commune en 22q13.33 se produit plus souvent chez les enfants autistes que chez les enfants non autistes, a découvert l’équipe. Une tendance similaire a émergé d’une analyse d’échantillons de cerveau cortical post-mortem de 27 enfants et adultes autistes et 30 non autistes. Des échantillons de cerveau avec une expression NHIP altérée ont également montré des différences d’expression dans plus de 500 gènes, y compris de faibles niveaux de CHD8, l’un des gènes les plus fortement liés à l’autisme.

Pour 77 des placentas, l’équipe de LaSalle disposait de données sur l’utilisation par les femmes de vitamines prénatales, qui contribuent aux molécules nécessaires à la méthylation. Celles qui ont déclaré avoir pris des vitamines au cours du premier mois de grossesse ont accouché de placentas avec des niveaux de méthylation plus élevés en 22q13.33 que celles qui n’en ont pas pris.

De grandes études pourraient tester si les porteurs de la variante structurelle devraient prendre des doses encore plus élevées de vitamines prénatales que ce qui est actuellement recommandé, dit Zhu.

T :es découvertes démontrent comment les gènes et l’environnement peuvent tous deux contribuer à l’autisme, explique Magdalena Janecka, professeure adjointe de psychiatrie à la Icahn School of Medicine du Mount Sinai à New York, qui n’a pas participé aux travaux.

“Vous avez des facteurs génétiques et environnementaux qui convergent vers les mêmes processus biologiques”, explique Janecka. “Je pense que c’est vraiment cool.”

La taille de l’échantillon est petite, dit Penn, bien que les études sur les placentas n’aient pas tendance à devenir beaucoup plus grandes. L’approche “sophistiquée” en plusieurs étapes des chercheurs donne du poids aux résultats, dit-elle.

L’utilisation de techniques pour séquencer la méthylation sur l’ensemble du génome, plutôt que sur certaines zones seulement, aide également, dit Janecka. “C’est une étude très élégante.”

La comparaison de la méthylation entre les groupes, plutôt que chez les individus, peut manquer des changements rares qui ne contribuent à l’autisme que chez certaines personnes, dit Janecka – de la même manière que certaines mutations génétiques rares se produisent chez un petit sous-ensemble de personnes autistes. L’utilisation de méthodes pour identifier ces changements rares pourrait révéler davantage de facteurs de méthylation qui contribuent à la maladie.

LaSalle dit qu’elle prévoit ensuite de caractériser plus complètement la fonction de NHIP et de déterminer si le peptide NHIP pourrait être utilisé à des fins thérapeutiques.

Citez cet article : https://doi.org/10.53053/RHMZ1935 :

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