Est-ce que l’origine des espèces de kumquat cultivées i:

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Crédit: Chenqiao ZHU, Peng CHEN, Junli YE, Hang LI, Yue HUANG, Xiaoming YANG, Chuanwu CHEN, Chenglei ZHANG, Yuantao XU, Xiaoli WANG, Xiang YAN, Guangzhou DENG, Xiaolin JIANG, Nan WANG, Quan WU, Hongxing SAN, Di FENG , Min YU, Xietian SONG, Zongzhou XIE, Yunliu ZENG, Lijun CHAI, Qiang XU, Chongling DENG, Yunjiang CHENG, Xiuxin DENG.

Kumquat (Fortunelle : spp.), une culture fruitière commune et un arbre d’ornement, se caractérise par de petits fruits savoureux et brillants ressemblant à des oranges. Le cultivé : Fortunelle : espèces (F. Marguerite :, F. crassifolia, et: F. japonica :) est connue pour être originaire de Chine et a été introduite en Europe pour la première fois par le botaniste anglais Robert Fortune pendant la période Daoguang de la dynastie Qing de Chine. Le kumquat sauvage de Hong Kong (F. hindsii :) est largement distribué dans le sud de la Chine et a été développé comme matériau modèle pour la recherche sur la fonction des gènes des agrumes en raison de sa nanicité, de sa courte juvénilité et de ses caractéristiques de monoembryon. Cependant, une question sur cette adorable espèce fruitière laisse perplexe les spécialistes occidentaux (Walter T. Swingle, 1871-1952) et orientaux (Tyôzaburô Tanaka, 1885-1976) depuis un siècle : Quelle est la relation phylogénétique entre cultivé: Fortunelle : espèce et la seule espèce sauvage existante dans ce genre : F. hindsii :? Le cultivé est-il : Fortunelle : espèces directement domestiquées à partir de : F. hindsii : ou son origine est-elle impliquée avec : F. hindsii :?

Pour répondre à ces questions, le Pr. Xiuxin Deng et son équipe ont systématiquement recueilli le représentant cultivé : Fortunelle : accessions et sauvages : F. hindsii : échantillons dans toute la Chine au cours des 10 dernières années. En utilisant le SSR nucléaire, le SNP du chloroplaste et le SNP génomique, la diversité génétique de : Fortunelle : genre a été évalué de manière exhaustive, et l’histoire de l’évolution de : Fortunelle : genre a été tracé. L’analyse génétique a clairement montré la phylogénie indépendante de: Fortunelle : genre parmi les taxons d’agrumes, qui a rejeté l’hypothèse de l’origine de l’hybridation de : Fortunelle. En outre, Fortunelle : genre présentait un : structure génétique évidente et forte différenciation génétique dans les deux principales populations cultivées : Fortunelle : population et sauvage : F. hindsii : population. L’analyse génomique a montré que les deux populations ont subi une sélection directionnelle au cours de leur trajectoire évolutive. La dynamique démographique asynchrone de : Fortunelle : population et sauvage : F. hindsii : la population pendant la période glaciaire quaternaire (QGP) était antérieure à l’activité humaine dans le sud de la Chine, et les signaux de domestication limités de ces deux populations étaient faiblement associés à leur différence de phénotype ensemble, ce qui implique que la population cultivée Fortunelle : les espèces ne peuvent pas être directement domestiquées à partir de la nature : F. hindsii :.

Sur la base des résultats de cette étude et du rapport phylogéographique précédent, Deng et son équipe ont soulevé une nouvelle hypothèse évolutive pour Fortunelle : genre. Après différenciation avec : Agrumes: genre, l’ancêtre de: Fortunelle : a évolué en une lignée indépendante largement distribuée dans le centre et le sud de la Chine. Parallèlement à la progression du QGP, le nord (l’ancêtre du cultivé : Fortunelle :) et populations méridionales (l’ancêtre de : F. hindsii :) ont été progressivement isolés génétiquement les uns des autres. La population du nord a été confrontée à une sélection naturelle plus précoce et plus sévère, connaissant ainsi un déclin démographique plus précoce, aboutissant finalement à une évolution adaptative telle qu’une peau épaissie avec l’enrichissement en sucre et en métabolites secondaires pour protéger les graines du gel. La population du sud a rencontré une sélection naturelle modérée et tardive, et a ainsi maintenu le phénotype primitif. Parallèlement à la migration des humains vers le sud, quelques individus de la population du nord ont été occasionnellement sélectionnés puis cultivés, et ainsi ils ont survécu jusqu’à présent, connus sous le nom de Nagami (F. Marguerite :), Meiwa (F. crassifolia :), et Marumi (F. japonica :). La population du sud a principalement subi une sélection naturelle continue et a été découverte successivement par les anciens horticulteurs chinois et les érudits occidentaux modernes, et ils ont été nommés respectivement “Shan Jin’gan” en chinois et “Hong Kong kumquat” en anglais.

Cette étude est innovante et éclairante, fournissant des informations utiles à la fois pour l’élevage et la conservation de : Fortunelle :. L’hypothèse évolutive offre également une nouvelle perspective pour une recherche approfondie sur la phylogénie de ce genre, qui nécessite encore des preuves plus solides telles que des preuves fossiles connexes et une méthode plus avancée telle que l’analyse pan-génome. Cette étude a été publiée dans le Journal de : Frontières de la science et de l’ingénierie agricoles : en 2022.

Article original:

Chenqiao ZHU, Peng CHEN, Junli YE, Hang LI, Yue HUANG, Xiaoming YANG, Chuanwu CHEN, Chenglei ZHANG, Yuantao XU, Xiaoli WANG, Xiang YAN, Guangzhou DENG, Xiaolin JIANG, Nan WANG, Quan WU, Hongxing SAN, Di FENG , Min YU, Xietian SONG, Zongzhou XIE, Yunliu ZENG, Lijun CHAI, Qiang XU, Chongling DENG, Yunjiang CHENG, Xiuxin DENG. NOUVELLES PERSPECTIVES SUR LA PHYLOGÉNIE ET ​​LA SÉCIATION DU KUMQUAT (FORTUNELLA SPP.) BASÉES SUR LE SNP DES CHLOROPLASTES, LA SSR NUCLÉAIRE ET LE SÉQUENÇAGE DU GÉNOME ENTIER. Frontières de la science et de l’ingénierie agricoles, 2022 : [Published Online] EST CE QUE JE: 10.15302 / J-FASE-2021436 :

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